新型コロナウイルス感染拡大防止のため、ビハール州政府の指示により3月31日までの期限ですべての教育施設、保育施設、映画館、博物館などが閉鎖され、菩提樹学園も3月17日～31日までの予定で臨時休園となりました。これにより、3月24日に予定されていた卒園式は、当面、4月1日に延期されました。しかし、5月末までロックダウンが延長され、6月以降は徐々に制限が解除されましたが、6月末時点で教育施設は7月末までの閉鎖が決定されました。
その後、ビハール州は7月16日~7月31日まで再ロックダウンとなり、さらにロックダウンが8月16日まで延長されたため、休園期間は8月末までとなりました。
ロックダウンは再度延長され、現在9月6日までとなりました。これに伴い、菩提樹学園も9月6日まで休園となりました。
その後、9月6日総合的なロックダウンは終了いたしましたが、教育機関は9月30日までの閉鎖が中央政府により通告され、菩提樹学園の休園期間も9月30日まで延長されました。